女人什么最重要的东西:档案和违约金方面法律咨询

2004年12月我作为在校大学生与广州天河某股份制公司签订了就业三方协议，上面规定劳动关系3年，违约金2500元（这里面有个小插曲，当时签订的时候劳动时间是两年，用的汉子“二”，公司说要回到广州盖章，把三份协议都拿走了，等传回来后，我和学校的手上那两份协议变成了“三”年，但是已经没有证据，当时作为在校学生，社会经验不足，只好吃了这个亏），2005年7月我大学毕业与该公司签订了三年劳动合同，（其中第一年为见习期），规定违约金7500元，当时人力资源经理说每年的违约金是2500，三年就是7500元，逐年递减。我的户口落在天河科技园集体户，档案通过一份“人事行政关系委托管理合同书”存放在广州天河科技园人才交流服务中心。
2006年2月我提出辞职，到了3月10日正式办理离职手续，期间公司虽然对我进行了口头挽留，但是只字未提违约金问题，在3月10日，离职申请表已经由部门经理和总经理签过了字，只剩下人力资源部和财务部的章没盖，不料到人力部签字时，那个人力部经理忽然翻脸，跟我要求违约金，并且把离职申请表扣下。我只好于第二天离开公司，但是没有什么书面证据。只有银行工资卡上的转帐记录表明公司给我的工资结算到3月10日。
2006年6月下旬我在江苏某地找到一份工作，该工作需要调档等手续，但是在此时发现天河科技园人才服务中心要求办理调档“须持原委托单位出具的终止委托函”。该规定在其网站上标注时间为2006年4月5日，具体规定见附
（http://www.thstp.com/NewWeb/ShowInfo.aspx?id=b607c58e-0190-41c5-a6cf-176928244f47）。
因为跟公司存在违约金问题，从公司开具中止委托函的机会渺茫，现在人才中心不放档案，我就无法在现单位成为正式员工，请问这种情况我该怎么办？人才中心这样做是否合法？我听说劳动仲裁的时限是60天，如果公司就违约金问题向我提出劳动仲裁是否已经过期？请熟悉法律的朋友帮忙看看。
另外，我现在身在外地，如果回广州办理这些相当麻烦，如果有必要的话想委托专业律师办理，如果有广州的律师朋友愿意提供法律咨询和委托代理，请留下联系方式或者联系本人qq：13120693，委托价格在本人承受范围内可以商量。
对了，期间进行了几次加班，没有加班费，但是没有书面证据证明我加班了
谢谢二楼的回答，但是有个问题，我手上没有解除劳动合同的证据，如果有这个，那我也不用烦恼了，实际上单位把我的离职表扣下了！上面有总经理和部门经理的签字，我只有工资卡上的工资转帐证明，二楼你是广州的律师么？如果是请留个联系方式，我来聘请委托你